本发明提供了一种配种选育方法、装置及电子设备，涉及配种选育技术领域，基于接收的配种记录和目标群体系谱，确定对象的亲缘关系矩阵；亲缘关系矩阵用于指示对象之间的亲缘关系；根据配种记录和亲缘关系矩阵，得到预设的选配因素的参数值；其中，选配因素包括血缘数目、第一属性的对象对应的选择指数和第二属性的对象对应的选择指数；基于选配因素的参数值，确定配种方案；根据配种方案确定出目标对象，以对目标对象进行配种。能够避免群体近交，进而避免了后代生产性能下降，优化了群体配种质量；另外，根据上述选配因素确定整个配种方案，能够对血缘数目进行合理分配，维持血统内品种血缘配种平衡。