本发明提供一种辣椒套种高杆作物立体栽培方法，涉及辣椒种植技术领域。该基于辣椒套种高杆作物立体栽培方法，包括育苗、整地、定植、套种、水肥管理、田间管理。通过东西方向的大垄和小垄间隔设置，配合在小垄上交错设置的玉米高杆作物，可在大垄位置形成波浪形阴影，可遮挡最强烈的午间阳光，且配合太阳的移动，可使辣椒植株利用波浪形阴影的移动，在获得充分的光合作用的情况下，不会长时间受到阳光直射，避免产生日烧病的情况，加强了本发明的实用性。