本发明涉及印刷技术领域，且公开了一种重离子微孔印版系统，其包括印版组件和抵压组件，所述印版组件包括工作台，所述工作台的顶端通过支杆安装有支板，所述支板的顶端放置有印版，所述印版的两侧均设有包边带，两个所述包边带分别向下弯折并与支板的侧面贴合；所述工作台的顶端开设有水平方向的滑槽，且工作台的顶端通过滑槽卡合滑动连接有两个关于支板对称的连接架，每个所述连接架的内侧均固定连接有与支板的侧面相对应的限位板，所述工作台上设置有用于驱动两个连接架沿滑槽同时向相反方向进行滑动的驱动机构。本发明由于制做印版材料是塑料薄膜材料，因此所制造的印版具有不溶胀、厚度均匀和不吸墨等优点。