本申请公开了一种用于制备极化氦三玻璃气室的玻璃管路装置。玻璃管路装置包括主玻璃管道和碱金属分叉管，碱金属分叉管包括依序连通的碱金属安瓿试管、碱金属净化管、碱金属贮存管，以及设置于碱金属净化管和碱金属安瓿试管连接处的自由落体管。在碱金属净化管倾斜设置时，自由落体管呈竖立或接近竖立设置；且自由落体管为封闭的管，通过开口与碱金属安瓿试管连通，自由落体管内部放置有可自由移动的磁性金属锤。本申请还公开了采用该种玻璃管路装置制备氦三中子极化玻璃气室的方法。本申请中的玻璃管路的设计不仅可以实现对碱金属的净化，还能实现对磁性金属锤的简单回收，在提高氦三玻璃气室品质的同时，也缩短了极化氦三玻璃气室的制备周期。