本发明属于玻璃瓶消毒领域，尤其涉及一种玻璃瓶消毒流水线，包括机箱，机箱的两侧对称设有分别用于进料和出料的传送带，机箱朝向传送带延伸方向的一侧转动设置有转盘，转盘的外圆周面上等间距均匀分布固设有六个第一支撑杆，每个第一支撑杆上转动套设有支撑盘，支撑盘的中部设有一根喷液管，喷液管上侧中部设有长条形的开口，喷液管内部设有第一通道，第一通道内滑动设有喷液头，喷液头能个滑动伸出第一通道，喷液头上沿轴线方向设有多个喷孔组；转盘后部连通用用于驱动转盘转动的驱动模块，转盘连通有用于向送液腔供消毒液的供液模块。本发明能够不间断连续工作对玻璃瓶进行消毒，并且消毒残留较少。