本发明涉及一种黄瓜成熟果皮颜色性状连锁的一个SNP标记及其应用，SNP标记是yb637005，位于黄瓜Gy14_V2参考基因组第4号染色体637005bp处，yb637005处碱基为C的黄瓜成熟果皮为黄棕色，yfSNP01处碱基为T的黄瓜成熟果皮为白绿色。一组用于检测权利要求1所述的与黄瓜成熟果皮紧密连锁的一个SNP标记的dCAPs引物对，包括yb637005的正向引物5′‑CCAATAAATTACCTGTTTCCAAGG‑3′和yb637005的反向引物5′‑TAACTATTTGAGAGCTGATTTGAAT‑3′。所述的dCAPs引物对在黄瓜成熟果皮颜色分子标记辅助育种中的应用。通过本发明，本发明利用基因组学和群体遗传学筛选到与黄瓜成熟果皮颜色紧密连锁的SNP标记，通过测序转化为dCAPs标记的方法鉴定黄瓜基因型，且该标记为共显性标记，可有效区分纯合体和杂合体，加速黄瓜果皮颜色分子育种进程。