本发明公开了一种镁铝异种合金焊接装置及方法，包括机箱和连接在机箱顶部的工作台，工作台顶部设有摩擦焊接机构；摩擦焊接机构通过安装件安装在龙门架上，工作台上安装有用于控制龙门架移动的第一移动机构，龙门架内设有用于带动安装件移动的第二移动机构；安装件一侧连接支撑杆，支撑杆远离安装件一端连接可调节角度的定位机构，用于确定焊接缝的位置；本发明中摩擦焊接机构和定位机构能同步移动，定位机构能确定焊接缝的位置，同时会使摩擦焊接机构的搅拌头对准焊缝，减少后续校准操作，龙门架在带动摩擦焊接机构移动时，定位机构在移动中能对镁合金和铝合金靠近缝隙处进行按压固定，提高焊缝成型质量，清理机构能对焊接缝进行清理。