本发明涉及胶囊运输技术领域，提供了一种排囊机构及胶囊输送装置。排囊机构包括壳体和第一排序板，壳体形成有排囊通道，排囊通道的上下两端设有胶囊入口和胶囊出口，壳体的一侧设有第一槽和第二槽，第一槽和第二槽上下相对分布于胶囊出口处且与排囊通道连通；第一排序板可往复摆动地设置于壳体的一侧，第一排序板的上下两侧形成有朝向排囊通道的第一阻挡部及第二阻挡部，第一阻挡部与第一槽相适配，第二阻挡部与第二槽相适配；第一排序板通过在第一位置和第二位置之间切换，带动第一阻挡部及第二阻挡部同步动作，交替进出排囊通道，实现单粒胶囊依次排放，避免对胶囊造成损伤，并且具有结构简单、成本低、使用方便等特点。