本发明公开了多相输入并联输出并联双有源桥变换器自动均流方法，多相输入并联输出并联双有源桥变换器中的每个子模块由第一开关电路、串联电感、隔离变压器、第二开关电路以及直流端口侧电容组成，通过一种循环扰动参数估算算法来估算各模块的参数不匹配度，一旦估算出各模块的参数，便可以计算出并联系统各子模块满足均流的补偿移相比，从而实现系统均流。本发明实现多相输入并联输出并联双有源桥变换器的自动均流，使每个子模块功率均衡分配；可用于新能源发电、电动汽车、航空航天、不间断电源、直流配电系统、储能系统等大功率并联开关电源场合，具有方法合理、实现方便、通用性好、体积小、成本低等诸多优点。