本发明涉及一种轨道交通车地通信潜在风险监测方法和系统。所述方法包括获取车载无线通信设备的联合数据和地面无线通信设备的联合数据，并将其匹配划分成多个对应不同传输链路的关联数据组；将单个关联数据组中的两个联合数据整合成对应传输链路的信差数据；采用所述传输链路两端的无线通信设备基于多个所述信差数据识别潜在风险。本发明通过采集车载无线通信设备和地面无线通信设备的大量通信数据，处理为信差数据，对车地通信长周期的大量信差数据进行统计分析，识别异常信差数据，从而定位车地通信存在的潜在通信风险，以便提前进行风险原因分析及处理，避免后续通信故障发生。