本发明公开一种文件系统保护方法、装置、可读存储介质及电子设备，接收主机发送的隐藏区域对应的操作命令；根据所述操作命令对所述隐藏区域的状态进行切换，并对所述隐藏区域对应的其他区域进行重新映射，得到重新映射后的其他区域；对所述重新映射后的其他区域进行访问，得到访问结果，实现关闭和打开隐藏区域，同时对其他区域进行重新映射，避免打开和关闭隐藏区域时导致文件系统无法使用的情况，且从硬件层面使隐藏区域无法被访问，从而提高了文件系统保护的有效性。