本发明涉及一种地下水循环井井内生物反应器功能组件及其使用方法，生物反应器功能组件配置于循环井井体内部限定空间中，以通过循环井抽注水组件实现生物反应器功能组件中地下水的流入和流出，其中，生物反应器功能组件基于不同的微生物反应类型至少配置有好氧反应室、兼氧反应室和厌氧反应室中两种或以上组合，以构成连通廊道的方式使地下水在生物反应器功能组件内通过好氧反应室、兼氧反应室和厌氧反应室的各种组合强化循环井系统去除地下水中有机污染物；生物反应器功能组件通过若干弹性铰链活动连接于循环井井体并设置在循环井井体内；生物反应器强化循环井修复系统的使用方法至少包括抽注水、吹脱气提捕集、尾气净化处理和污泥抽提等步骤。