本发明公开一种频率源动态控制方法、控制装置及系统，包括如下步骤：对主频率源与备用频率源分别进行合格性检测，主频率源的频点为主频点，对主频率源与备用频率源进行主频点对正，对正完成后的，对主频率源与备用频率源进行主频点一致性检测与调试，调试完成后备用频率源进行休眠，启动主频率进行工作，主频率源发生故障时，备用频率源根据对正的主频点代替主频率源进行工作；若主频率源未发生故障，则关闭主频率源，通过将备用频率源从休眠状态唤醒，待干扰消除后，主频率源继续工作，在设定的时长内未接收新的工作，则主频率源进入待机状态。通过本发明，可以实现在不同的环境下，对频率源进行动态控制，确保雷达工作正常。