本申请公开了一种匿名签署电子合同的方法，涉及数据安全技术领域，包括以下步骤：接收合同签署方签订的第一电子合同和其第一公钥，并向其发送授权证书；根据第一电子合同生成包含第二电子合同和与第二电子合同对应的物流电子合同，并发送给合同签署方；接收合同签署方利用各自的第一私钥签订的第二电子合同和物流电子合同，并将利用第一私钥生成的第一数字签名发送给合同签署方和物流平台；接收合同签署方和所述物流平台对所述第一数字签名进行验证的结果，并根据该结果向物流平台发送执行物流电子合同的消息。本方法通过为合同签署方颁发用于匿名签署电子合同和物流电子合同的授权证书，使得合同签署方拥有了匿名签署电子合同的能力。