本发明公开了自动过滤器更换装置，包括流通管，所述流通管上连接有第一截止阀，所述流通管上距离所述第一截止阀间隔设置有第二截止阀，所述流通管靠近介质流出的一端设有检测组件，所述第一截止阀与所述第二截止阀下方均连接有过滤单元，所述过滤单元包括连接在所述第一截止阀和所述第二截止阀左右的进流管道和出流管道，所述过滤单元还包括能够过滤外壳体，各个所述过滤单元以及所述检测组件均通过连接线路连接到单片机。本发明通过所述检测组件检测所述流通管内介质流量，并通过单片机控制所述第一电磁阀以及所述第二电磁阀来更换流通路径，进而实现自动更换过滤单元，且上述方案可根据需求扩增电磁阀来获得更多的流通路径。