本发明公开了一种基于斩波技术消除电极间直流偏移的方法及系统，包括以下步骤：步骤S1：输出斩波调制后的脑电信号和电极间直流偏移信号；步骤S2：输出电极间直流偏移电流；步骤S3：提取积分直流偏移信号；步骤S5：所述脑电信号进入芯片放大模块进行放大处理，解调制，并返回至原始的脑电信号频段，得到原始的脑电信号；步骤S6：所述原始的脑电信号经过低通滤波器滤波得到滤除噪声的脑电信号；步骤S7：将所述滤除噪声的脑电信号传入数模转换器转换为数字信号。本发明有效抑制了电极间直流偏移，相比传统的直流伺服回路减小了过程延时，同时，电路中输入电容与前馈电容容值相同，可采用ABBA式版图排列方式，有效避免了芯片制作时的工艺误差。