本实用新型涉及清洁除菌技术领域，且公开了一种新生儿保温箱用清洁除菌设备，包括驱动组件，驱动组件的外侧面活动连接有清洁组件，驱动组件的外侧面固定连接有消毒组件，驱动组件的外侧面固定连接有杀菌组件，驱动组件的末端固定连接有固定组件，驱动组件包括有安装套，安装套的外侧面开设有均匀分布的活动槽与安装槽，活动槽与安装槽相邻分布，清洁组件包括有活动杆，活动杆的前端与安装套所开设的活动槽内壁活动连接，活动杆的内部固定套接有第二电缸，第二电缸的输出轴末端固定连接有电机，该清洁除菌设备实现在新生儿保温箱中便捷的清洁操作效果，该清洁除菌设备可以长时间在新生儿保温箱中进行杀菌消毒的操作。