本实用新型提供一种自动跑极电法测量系统，电极组包括供电电极和测量电极，所述供电电极与供电电源连接，所述测量电极与数据采集系统连接，所述供电电源对所述供电电极供电，所述数据采集系统用于采集测量电极的电压；所述电极组用于伸入至水面以下，具有在水平面上和竖向上的活动行程；所述电极组安装于所述三维运动系统上，所述三维运动系统驱动所述电极组在平面和竖向上的移动。本实用新型提出的技术方案的有益效果是：将电极组安装于三维运动系统，三维运动系统实现电极组在平面上和竖向上的移动，完成整个实验室水槽电法模拟实验，在整个实验过程中，电极能够自动运行到指定位置进行测量，从而避免了反复移动电极和搬运仪器的劳动。