本实用新型公开了一种装配式集装箱房屋的防水结构，包括第一集装箱房屋和第二集装箱房屋，所述第一集装箱房屋和第二集装箱房屋侧面相贴合处设有缝隙，所述缝隙内设有箱间防水胶，所述第一集装箱房屋和第二集装箱房屋相邻处的顶部设有防水盖条，所述防水盖条的宽度大于缝隙的宽度，所述防水盖条两侧通过一组紧固件分别安装在第一集装箱房屋和第二集装箱房屋顶部。本实用新型所述的装配式集装箱房屋的防水结构，通过箱间防水胶防止相邻的集装箱房屋之间的缝隙内发生渗水，通过防水盖条进一步防止雨水进入相邻的集装箱房屋之间，避免集装箱房屋相接处积水引起集装箱房屋锈蚀，该结构设计巧妙合理，防水效果好。