本发明涉及一种生物复合肥及其制造方法，生物复合肥包括载体和菌种剂，载体由塘、河或湖泥，食品罐头业角料，酿造业下脚料，畜或禽的排泄物，化肥及活性炭组成，在生产此生物复合肥的过程中，采用将发酵菌液直接喷洒到载体上的方法，简化了工艺过程，降低了成本，减少了投资，由于有活性炭，利用其吸附能力，使菌肥中的有效成分可随着环境浓度的大小，缓慢释放或贮存，在使用过程中使单位体积含菌量及养分的损失率减少13-17％，增加肥效，对粮食与蔬菜作物具有非常明显的增产效果。