本发明涉及一种微流控芯片的制备方法，选取玻璃组分，加入适量的光敏剂和晶核剂，高温熔制、拉制或浇注成片状，经研磨抛光成玻璃片，依次经光辐照、高温及酸腐蚀处理，制备出具有微流通道、液池、高压隔离结构和集成电极用孔穴阵列的玻璃芯片，利用等离子体化学气相沉积法、热丝化学气相沉积法或高温裂解法在玻璃孔穴中集成纳米碳管工作电极，参比电极、电泳分离电极分别集成在相应孔穴中，经封装而成。该微流控芯片具有电泳分离、反应及电化学检测功能，结构稳定、寿命长，信噪比低、检测灵敏度高、检测范围广等优点。