本发明公开了一种具有非均质的涂层的医用材料及其制备方法。它由医用基体和涂覆在基体表面的非均质涂层组成，所说的非均质涂层是在含锰和含氟的钙磷酸盐涂层中分布大小为200nm～20μm的含锌、镁或锶的钙磷酸盐或钙碳酸盐团聚体形成。其中含锰或含氟的钙磷酸盐涂层表面具有高表面电势吸附功能，有利于促进细胞在其表面的吸附，含锌、镁或锶的钙磷酸盐或钙碳酸盐团聚体具有离子释放功能，通过释放有益离子的方式促进细胞发挥蛋白质分泌、促进矿化等。本发明的医用材料能够促进细胞在其表面的附着及增殖，具有强化的生物活性性能。而且涂层与金属基板的结合强度高，稳定性好。