本发明涉及一种分离制备低杂质含量、澄清透明的食品级卵磷脂的方法，尤其是一种利用无机陶瓷膜分离制备低杂质含量、澄清透明的食品级卵磷脂的方法。属于食品添加剂的分离提纯领域。本发明分离制备低杂质含量、澄清透明的食品级卵磷脂的方法：取一定质量的饲料级大豆卵磷脂，加入重量体积比为3－7倍的工业己烷溶解，配成溶液，用0.1－1.2μm的无机膜在40－55℃、过滤压力为0.1－0.4MPa下过滤，浓缩至总体积的1/10－1/7，得到的滤过液经过蒸发得到本发明产品卵磷脂。本发明产品的大豆卵磷脂可以达到食品级要求，可用做乳化剂、润湿剂、防溅剂和脱膜剂。可以广泛地应用在食品、化妆品等领域中。