本发明的目的在于提出一种医学成像系统的时间自校正方法，用来使医学成像系统的应用程序即使在系统时间被修改的情况下仍然能够取得准确的当前时间并进行相应计算，其包括以下步骤：使用一个后台程序监视系统时间，当系统时间被修改时记录修改的方向和修改量；使该应用程序取得系统时间以及上述后台程序对系统时间被修改的记录；以及当后台程序没有系统时间被修改的记录时，该应用程序使用取得的系统时间作为当前时间；当后台程序有系统时间被修改的记录时，该应用程序根据系统时间被修改的方向和修改量对取得的系统时间进行校正，并使用经过校正后的时间作为当前时间。