本发明涉及一种硬盘保护系统，通过检测一硬盘的三维移动状态，以中断该硬盘的读取动作，该系统包括有：一检测模块，用以检测该硬盘的一X轴移动量、一Y轴移动量以及一Z轴移动量；一控制模块，用以将该X轴移动量、该Y轴移动量以及该Z轴移动量经过一算法的运算，以决定是否发送一中断信号；以及一处理模块，用以接收该控制模块发出的该中断信号，以中断该硬盘的读取操作。本发明不需外接一模拟/数字转换器，则可更加迅速的判断出是否处于危险状态并自动中断硬盘操作以提供保护，避免由于晃动剧烈而导致硬盘损坏。为用户提供了乘车使用或意外跌落笔记本时的抗震服务。