本发明公开了一种高精度数字时频标合成方法，该方法是：A.采用全数字鉴相与频率合成，将频率产生与矫正分离；振荡器工作在自由振荡模式；B.采用高精度的相位累加的方法实现频率合成，结合数模转换后输出到滤波器进行降噪处理；C.采用数字滤波的方法，对鉴相数据处理，得出振荡器的频率偏差；D.采用将输出频率信号分频后送入鉴相器，实现频率合成质量的监控。本发明采用全数字鉴相与频率合成，将频率产生与矫正分离，解决了控制耦合问题；振荡器工作在自由振荡方式，相噪更低，稳定性好；同时支持多参考源并行处理，非常适合于卫星授时等高精度时频标合成场合。