一种自动开合系统，适用于一掀盖式电子设备，用以自动开合该掀盖式电子设备的上盖，其中，该自动开合系统借由一触发模块以提供一上盖开启信号以及一开机信号；且借由一侦测模块以于该电子设备呈现开机状态时侦测该电子设备的使用状态，并于该电子装置闲置一预设时间后或该电子装置被关机时，输出一上盖闭合信号；再将该触发模块所产生的上盖开启信号或该侦测模块所输出的上盖闭合信号传送至一动力装置，以开启或闭合该掀盖式电子设备的上盖。因此，本发明可令掀盖式电子设备自动开合上盖，以避免电子设备的上盖因手动操作时用力不均而造成损坏的情形，且可设定相应的触发条件以控制执行该自动开合作业，提升掀盖式电子设备中的数据的安全性。