离子交换法从发酵液中提取L－异亮氨酸的清洁生产工艺，属于生物化工技术领域。包括L－异亮氨酸制备，离子交换柱再生，再生后所得硫酸铵废液的循环利用；L－异亮氨酸制备包括发酵液的加热过滤，调酸、絮凝过滤，滤清液用强酸性氢型离子交换树脂柱吸附，吸附饱和后用水冲洗去杂质，用加含铵废水的氨水洗脱，将洗脱液即L－异亮氨酸溶液再次用强酸性氢型离子交换树脂柱吸附，吸附饱和后用水冲洗去杂质，用氨水洗脱，洗脱液脱色后进行浓缩结晶，得L－异亮氨酸成品。洗脱后的离子交换柱用硫酸进行再生，流出的硫酸铵废液一部分直接用于发酵培养基的配料，其余部分加氨水调节后作为第一次离子交换的洗脱液，形成闭路循环，可显著降低废水处理难度，极大提高经济效益。