本发明提供一种使用射频识别的制造控制系统，其包括一触发器、射频识别感应器、控制器及指示器。其中该触发器，当其通过使用者接触而被启动时，发出一触发信号。该射频识别感应器，当其被启动时，读取一射频识别标签中储存的信息。该控制器，其是用以启动该射频识别感应器，并依据该触发信号发出一控制信号。该指示器，其接收该控制信号，并据以动作，其并提供该射频识别感应器的操作状态及/或该控制信号内容的指示信号。本发明可以以接触控制的方式，使用射频识别感应操作来进行生产控制，可避免制程中出现的控制错误。