一种计算机平台嵌入式操作系统切换处理方法及系统，搭配至一计算机平台，提供一备用操作系统切换处理功能，该计算机平台嵌入式操作系统切换处理系统包括：开机主控模块、操作系统检测模块以及操作系统加载信道切换模块，还可包括系统映像写入模块和警示模块；本发明设置一操作系统状态旗标，显示每一次开机后的主用操作系统程序码的执行状态是否正常，之后再度开机时即可依据此操作系统状态旗标当前的设定值，判断主用操作系统程序码是否有发生损毁状况；若是，切换到备用的操作系统程序码来进行开机程序，本发明比现有技术的查错方法更为快速及方便地判断主用操作系统程序码是否有误，操作系统加载开机程序的执行过程更为快速而有效。