本发明为一种证件指纹识别算法评价系统及其方法，在搭建的测试平台上建立测试样本指纹库和测试模块，被测的证件指纹识别算法通过测试模块接口按照接口协议提交到测试平台，被测试算法在测试平台上取指纹测试库中的指纹文件进行“一对一”比对，测试模块根据对比结果统计出被测算法的各种识别率指标、识别时间和易用性指标等。本发明证件识别算法评价系统及其方法操作简单、评测结果真实可靠，能客观公正地对指纹识别算法的优、劣，系统的易用性等方面做出评判。