本发明涉及一种发光指示设备的控制方法及其装置，特别是一种呼吸灯的控制方法及其装置。本发明通过采用定时器对时间的精确控制，且所述定时器的最大周期小于或等于100ms，由输出的不同占空比的发光、熄灭的信号控制发光单元以时变的占空比不断闪烁，从视觉上则显示为明暗有规律地变化，即由暗到亮，由亮到暗，再由暗到亮，周而复始，这种明暗的变化被人们感觉到的是线性的、均匀的变化，可通过对明暗周期的控制，与人的呼吸周期相吻合，发光效果非常生动。而且，本发明不是直接控制输出电流或输出电压的大小来调节LED的明暗。而是通过软件的手段控制LED亮和灭的时间比例来调节亮度的，稳定性更高，也更利于对各参数的调节。