本发明涉及一种从三瓣木兰植物中提取的抗真菌活性成分及其应用，属生物医药技术领域。本发明的活性成分经如下步骤得到：a.将三瓣木兰的枝或叶用水洗干净后，在烘箱中于60℃温度下烘干；b.将烘干后的枝或叶切碎，放入三角瓶内，用80％的乙醇浸泡，在40℃的水浴锅上提取，第一次浸泡提取的时间为2小时，第二次和第三次的时间分别为4和8小时；c.将三次浸提的提取液合并后，在低压0.07MPa下浓缩至溶剂蒸发后得浸膏；d.将浸膏用甲醇溶解，制备成浓度为5mg/ml的活性成分。本发明的活性成分具有对人体病原真菌淡紫拟青霉有抑制作用、高效、热稳定等优点，可作为制备抑制人体病原真菌淡紫拟青霉制剂的应用。