本发明公开了一种鉴定白化苗基因型愈伤的方法。首先是用杂合基因型种子诱导愈伤，剥去谷壳，乙醇和汞浸泡一定时间，用灭菌水清洗后置于诱导培养基上，放置在光照培养室诱导愈伤；其次是抽提愈伤DNA，把诱导的愈伤剥离下来，放在继代培养基上，挑取一粒诱导出的愈伤，利用CTAB法抽提愈伤总DNA，加入水溶解；第三是通过PCR扩增愈伤总DNA，白化苗基因型中a+b不扩增，a+c扩增，用TBE胶电泳PCR产物检测愈伤基因型；第四是挑选出经PCR检测的白化苗纯合基因型愈伤，置于分化培养基上，放置在光照培养室，进行分化验证。用该方法可鉴定由T－DNA插入造成的纯合隐性基因失活而导致的致死、不育、早衰等无法收到种子的突变体的纯合基因型的愈伤，用于功能互补实验。