本发明公开了一种数据透明保护的安全读写系统和方法，包括硬件平台，虚拟机监视器，以及至少一个操作系统，硬件平台包括存储设备，存储设备包括数据保护保留分区(2)，用于保存每个数据保护点的MBR，数据分区的文件分配表和保护点状态表；虚拟机监视器包括数据保护模块(1)，用于设置存储设备的保护点，并将保护点的MBR，数据分区的文件分配表和保护点状态表保存到所述数据保护保留分区(2)，以及对存储设备的保护点进行变更操作；截获操作系统本身以及运行在操作系统之上的程序访问存储设备的I/O操作指令，并把所述指令根据重定向到存储设备上正确的位置读写存储设备的数据。其达到透明保护存储设备数据的目的。