本发明公开了一种外挂式重要数据保护系统及其保护方法，包括重要数据保护平台、应用系统、加密设备和用户数据中心；在对数据进行加密时，通过应用系统将需要文件需要保护的保护参数进行设定，并传递给重要数据保护平台，其中重要数据保护平台内的业务节点将自动分配空闲的计算结点，然后加密设备生成相应的加密密钥，并将加密密钥传递给计算结点，则计算节点则根据加密密钥根据应用系统传递的需要保护的保护参数进行加密保护，并形成加密密文，并将加密密文以及源文件传递给用户数据中心进行存储。本发明通过增设加密设备，在对文件进行加密，从而保证了数据文件具有较高的隐私性，不易被泄露。