本发明提供用于实体肿瘤的预后或评估实体肿瘤治疗的方法、系统和仪器。实体肿瘤的预后的基因标志可根据本发明鉴别。抗癌治疗开始后，实体肿瘤患者的PBMC中，各基因标志均具有改变的表达模式，且所述改变的量值与所述患者的临床结果相关。在一个实施例中，使用Cox成比例危险模型(Cox proportional hazards model)判定CCI－779治疗期间RCC患者的临床结果与所述患者的PBMC中基因表达变化之间的相关性。Cox模型所鉴别的基因的非限定性实例描绘于表4A、4B、5A及5B中。所述基因可用作RCC预后的替代标志。其也可用作CCI－779或其他抗癌药物的功效的药物基因组学指标。