本实用新型涉及一种永磁发电机的冷却系统，尤其是大功率永磁发电机的冷却系统。其主要包括发动机、永磁发电机，永磁发电机定子安装在发动机飞轮壳上，永磁发电机转子安装在发动机曲轴上，特征是永磁发电机转子安装风叶的一端与发动机曲轴相连接，与永磁发电机转子相连接的风叶设置在发动机飞轮壳与永磁发电机之间。本实用新型通过转子的旋转来带动风叶旋转，产生冷却风来强制对永磁发电机的转子、和定子进行冷却，减小定子的热量对转子上永磁体的热传导，具有良好的风冷效果；在机组整体结构尺寸不增大的情况下，能大大提高永磁发电机定子线圈与永磁体转子的冷却效率，保证了永磁发电机的持续工作的可靠性，并可延长永磁发电机的使用寿命。