一种消化道吻合器，包括通过定位杆与钉仓组件相接的抵钉座，定位杆上设置有定位。定位包括设置在定位杆上的一个及以上的环状定位突起，定位突起上下间隔布置。定位也可以包括设置在定位杆上的一个及以上的环状凹位，该凹位上下间隔布置；该定位还包括套设在凹位上的弹性套，弹性套的内径介于凹位的外径与定位杆的外径之间，其外径大于定位杆的外径。本实用新型于原本光滑的定位杆上预先设置有定位，医生可根据不同的病例，决定将线结固定在不同的位置，不仅避免了手术过程中直肠粘膜切除多少的随意性及不均匀性，极大的提高了手术的成功性，还免除医生用手指牵拉线结，降低了手术的难度，节约了手术时间，减轻了患者的痛苦。