本实用新型提供了一种微球自动分选装置，所述的装置包括多个直径相同的盘、摆动杆、电机和安装架。电机固定在安装架上，安装架上设置有支点柱和弧形凹槽，凹槽中设有滚珠。摆动杆上设有多个支点孔，并通过安装架的支点柱与安装架连接。盘底部为半球形，球形壁上设置有微型通孔阵列，多个盘的微型通孔直径成梯次设置，多个盘置于摆动杆的圆孔板的对应孔上。当电机旋转时，带动电机旋转轴上的偏心轮旋转，偏心轮推动摆动杆摆动，摆动杆带动盘摆动，微球滚动到各盘壁上的微型通孔处，比通孔直径小的微球就从孔中落到下一盘中，达到分选的目的。本实用新型结构简单，原材料来源广，制作成本低，应用广泛。