一种搅拌器结构，包括一杯体、一搅拌装置、一驱动连杆、一抽气唧筒以及一第一单向阀，该杯体内可容置需要搅拌调和的医疗物质，该搅拌装置连接于该杯体顶部，该搅拌装置包含一齿轮组与一搅拌棒，该搅拌棒一端连接于该齿轮组，该搅拌棒另一端插入该杯体内，该驱动连杆两端分别枢接于该齿轮组与该抽气唧筒，该抽气唧筒一端贯穿该搅拌装置，且该第一单向阀连接于该抽气唧筒中；借助以上的设计，搅拌过程中，该齿轮组转动带动该抽气唧筒对该杯体内的气体进行抽气，使得搅拌后的医疗物质凝固后，因为没有气体的渗入，所以不会产生许多气孔，质地坚固耐用，提高了医疗质量。