本实用新型涉及一种变量凝胶制备模具，其包括凝胶成型槽、凝胶打孔梳、纵向挡板、横向挡板；凝胶成型槽为一底板的三边设有侧壁，另一边敞开的结构，相对的两侧壁分别设有卡槽，用于卡制凝胶打孔梳；该凝胶打孔梳上设有一段无齿区，所述横向挡板上设有向上开口的凹槽，该凹槽卡制于所述凝胶打孔梳的无齿区；所述横向挡板上还设有多个向下开口的卡槽；所述纵向挡板卡制于该横向挡板的其中一卡槽中。本实用新型所述变量凝胶制备模具可以通过调节横向挡板和纵向挡板的位置来实现制备琼脂糖凝胶的变量调节。本实用新型可以满足不同大小实验的琼脂糖凝胶制备的需要，节省了实验材料，有效地提高了工作效率。