本实用新型公开了一种自动切断氢气保护的质子交换膜燃料电池，属于燃料电池技术领域，包括电堆、氢气供应系统、控制器，氢气供应系统由与电堆相连的氢气进气管道、氢气放气管道组成，在氢气进气管道、氢气放气管道分别安装有电磁阀、电磁阀，电磁阀、电磁阀皆由控制器控制，在氢气进气管道上还安装有与电磁阀并联设置的手动进气装置，当燃料电池的其中某一项参数达不到要求时，控制器即刻会发出指令切断氢气源，从而有效保护电堆；当需要再次启动燃料电池时，只需按下手动进气按钮，氢气进入到电堆内，燃料电池完成启动，然后进入正常工作与保护状态。