本实用新型涉及一种梯度变形胶电泳支架及包括该支架的变性梯度凝胶电泳系统。所说的梯度变形胶电泳支架，包括支架、底座、制胶玻璃板和位于支架上部的缓冲液槽，其特征在于，制胶玻璃板的两侧通过胶条密封，在底座上有可移动的琼脂盒，制胶玻璃板的下端能插入琼脂盒内；缓冲液槽的进液口设置在缓冲液槽的底部，支架上还设置有缓冲液流速开关。上述电泳支架与电泳控温槽、梯度混合仪和程控电泳仪组合构成变性梯度凝胶电泳系统。本实用新型具有凝胶边缘电泳电场均一，上样时样品不易漂浮，凝胶下端密封严密的优点，使用该系统可以让使用者安全高效地进行DGGE实验，可获得更为稳定可靠的实验结果。