本实用新型属于车用控制装置范围，尤其是一种发动机智能飞轮控制器及其控制方法。包括有数字核心电路(1)、接插件电路(2)、CAN通讯电路(3)、PWM信号转换与功率驱动(4)、转子信息检测及处理电路(5)、电压、电流检测及处理电路(6)和电源电路(7)。该控制器采用独立的数字核心子板与由外围电路构成的母板相结合的硬件结构，应用直接磁链控制算法分别实现智能飞轮电动与发电状态的控制。控制器可以与多种速度传感器接口；子板、母板独立设计使其维护、升级比较简单；系统性能受飞轮参数的影响小；转矩响应速度快，使得发动机的起动时间更短、带电气负载能力更强。