本实用新型公开了一种多功能医疗器械清洗装置，包括进水口、水龙头和至少一个清洗槽，所述进水口与水龙头相连，所述清洗槽底部设置有出水口I；还包括至少一个底部设置有出水口II的酶洗槽，所述酶洗槽还设置有加热装置和超声波清洗装置，本实用新型将多酶恒温浸泡、循环加压冲洗、超声波空化等高效清洗技术有机结合于一体，能够在同一个清洗过程中，实现喷淋冲洗和超声波冲洗，可对常规清洗方法难以处理的器械进行全方位清洗，同时清洗能耗较低，产品体积较小，性价比高，适合大规模地推广和使用。