本实用新型涉及一种磁导航电子内窥镜，包括一端具有透明罩的外壳，所述外壳内固定有磁体、所述透明罩的内侧设置有摄像头和照明单元，所述外壳内还设置有与所述摄像头相连的视频处理模块，所述照明单元与设置在外壳内的电池相连或通过导线与外接电源相连，所述视频处理模块的输出信号通过导线上传或通过无线发射模块发射出去。本实用新型将光源及摄像头等成像系统完全集成于弹丸式壳体内，放置入膀胱后通过磁导航装置的磁场变化，吸引或推动所述固定在外壳内的磁体进而带动整个内窥镜移动，脱离置入装置末端并在膀胱内进行拍摄观察，体积小、重量轻，通过病患体外磁场变化即可操作内窥镜的拍摄，极大地减轻了病患的痛苦和心理负担。