本发明公开了一种防治蓝藻的设备，包括有安装在船体前部的混合装置，转动连接在混合装置两侧的两输入管，连接在两个输入管另一端的淤泥收集装置，一端与混合装置连接，另一端设置在船体尾部螺旋桨附近的输出管，以及安装在船体后部上方的用以调整淤泥收集装置高度的升降装置；通过淤泥收集装置的淤泥搅拌叶片将河底淤泥与河水混合，通过吸水泵将带水的淤泥经输入管抽到混合装置中，混合装置将带水淤泥搅拌，与从药水桶加入的药水混合均匀后，从出水管排出，经过船体螺旋桨的作用，将淤泥均匀地撒到水面上，淤泥在沉降过程中吸附水中的富营养化成分并带到河底，改变了河水的富营养化程度，破坏了蓝藻的生存条件，起到防治蓝藻过度生长的作用。