本发明涉及一种对药品食品粉末瞬时定量灭菌的系统，系统中：物料仓下部为斗形不锈钢料斗，出料口位于料斗底部；定量储料罐顶部与料斗对接，出料口配有不锈钢电动阀；瞬时过热蒸气灭菌装置包括密封腔体和过热蒸气发生装置，密封腔体的顶部设有进料口和负压抽气口，底部设有无菌高压冷干气输入口和排放口；密封腔体中配有含中空通道的搅拌桨，中空通道的壁和搅拌桨的桨叶都设有过热蒸气喷气口；冷却分离卸料装置包括冷却通道和粉末分离器，冷却通道为夹层管道，夹层管道中的夹层为冷媒通道，夹层管道设有集料口和排放口；粉末分离器上的上部设有粉料入口和负压抽气口，下部设有卸料口，卸料口上配有卸料阀。