本发明公开一种基于量子点材料的生物探针、制备方法及应用，包括量子点材料和包覆于量子点材料外的修饰材料；所述量子点材料包括至少一个在径向方向上依次排布的量子点结构单元，所述量子点结构单元为径向方向上能级宽度变化的渐变合金组分结构或径向方向上能级宽度一致的均一组分结构。本发明对量子点材料进行表面修饰，形成生物探针，其具有灵敏度高、荧光强度高、化学稳定性好、抗光漂白能力强等优点，尤其适合于细胞成像和生物检测等领域中。